Visualizando al sector palmero mexicano con un gran potencial para coadyuvar en el desarrollo del sur sureste de México, en el año 2018 el Fondo Mixto CONACYT – Gobierno del Estado de Tabasco, emitió la convocatoria denominada "Fortalecimiento de la infraestructura para el desarrollo tecnológico y la innovación de la actividad agroindustrial del estado de Tabasco".

La Federación Mexicana de Palma de Aceite (FEMEXPALMA), con una visión de establecer una estrategia integral para avanzar en primera instancia hacia la sustentabilidad del sector palmero mexicano, respondió a esta convocatoria con una propuesta innovadora en la cual participaron cinco instituciones nacionales del sector académico y de investigación. Juntos, sembraron la semilla más importante en el camino de la Federación, y la denominaron CIISPALMA

Al inicio de sus operaciones, el CIISPALMA se centró en la mejora de las prácticas agrícolas y la promoción de la sostenibilidad en el sector de la palma de aceite. Con el tiempo, su atención y su compromiso llamaron la atención de la comunidad agrícola en general en el sureste mexicano.

La demanda de sus servicios y la necesidad de mejorar las prácticas agrícolas en otros cultivos llevaron a CIISPALMA a expandir su enfoque. Hoy en día, CIISPALMA es una Centro que promueve la sostenibilidad, la calidad y la excelencia en toda la agroindustria del sureste mexicano. De esta manera el CIISPALMA evolucionó para ser un Centro de Investigación y servicios integrales referente del Sur Sureste Mexicano.